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全球首发NeoantigenEditing病原体AI智能编辑软件MAP架构图

On 8月 Ago
zw

全球首发NeoantigenEditing病原体AI智能编辑软件MAP架构图

近期,LukszaLAB生信实验室,推出了NeoantigenEditing病原体AI智能编辑软件,用于计算新抗原质量和执行克隆组成预测的代码。
这是全球目前最前沿的AI智能肿瘤免疫分析系统。


LukszaLAB生信实验室,是全球顶尖的肿瘤免疫研究机构,从事计算生物学和进化生物学等广泛领域的研究。
LukszaLAB生信实验室,学术团队非常强悍,通过将信息理论,统计学和AI人工智能方法结合,探索复杂的DNA遗传基因。
主要研究领域是:对病原体和癌症等快速适应系统的进化,以及免疫系统的干扰如何塑造。

本项目相关论文,2022年发表于:全球顶级科学杂志《Nature自然》。
论文:
《Neoantigen quality predicts immunoediting in survivors of pancreatic cancer》
(新抗原质量预测胰腺癌幸存者的免疫编辑),《Nature自然》 2022
论文大致的医学含义是:那些LTS(生存期长患者),他们的免疫系统如何对肿瘤进行塑造,也就是所谓免疫编辑。
研究免疫系统怎么塑造肿瘤进化,进而影响肿瘤患者的生存如何。

2022年5月,项目组在Github发布了相关软件的核心源码:
https://github.com/LukszaLab/NeoantigenEditing

RealMED生信团队,凭借自主研发RMPython生物信息AI智能开发平台,成为全球少数独立完成NeoantigenEditing软件逆向工程研究的团队。
近期,RealMED生信团队,全球首家发布NeoantigenEditing病原体AI智能编辑软件,全套核心模块库的MAP架构图,包括:

align_neoantigens_to_IEDB,患者新抗原IEDB对齐模块

compute_fitness,克隆新抗原质量和适用性分析模块

predictions_clones,复发性肿瘤克隆频率预测模块

redictions_aggregated_loglikelihood_scores, 肿瘤进化模型分析模块

这是继2021年,RealMED生信团队,全球首家构建AlphaFold 、RoseTTAFold模块库架构图后,国内生信团队,再一次与国际前沿同步前行的成功案例。
RMPython,是国内少数自主开发、技术领先的,集成式生物信息、AI智能开发平台。系统整合了BioPython、PyTorch等多种专业级生物信息、DNA基因分析、AI人工智能模块库。

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